O Projeto GEF Mar desenvolve ações voltadas à ampliação e fortalecimento do Sistema de Áreas Marinhas e Costeiras Protegidas (AMCP) como um todo, além de apoiar diretamente a consolidação de 15 unidades de conservação marinhas e costeiras federais, 6 unidades de conservação marinhas e costeiras estaduais e 7 centros de pesquisa do ICMBio voltados para a conservação marinha e costeira, listados abaixo:
Unidades de Conservação Federais
- Área de Proteção Ambiental de Fernando de Noronha - Rocas - São Pedro e São Paulo / PE
- Área de Proteção Ambiental da Costa dos Corais / PE
- Parque Nacional Marinho de Fernando de Noronha / PE
- Reserva Biológica do Atol das Rocas / RN
- Parque Nacional da Lagoa do Peixe / RS
- Refúgio de Vida Silvestre da Ilha dos Lobos / RS
- Área de Proteção Ambiental da Baleia Franca / SC
- Parque Nacional Marinho dos Abrolhos / BA
- Reserva Extrativista de Canavieiras / BA
- Reserva Extrativista Marinha do Corumbau / BA
- Reserva Extrativista de Cassurubá / BA
- Área de Proteção Ambiental do Arquipélago de Trindade e Martim Vaz
- Monumento Natural das Ilhas de Trindade, Martim Vaz e do Monte Columbia
- Área de Proteção Ambiental do Arquipélago de São Pedro e São Paulo
- Monumento Natural do Arquipélago de São Pedro e São Paulo
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